Sällskapsdjur
New Mexico har en mängd djur inhemska delstaten. Däggdjursarter inkluderar kanadensisk lodjur, Gunnisons präriehund, svartfotad iller, mindre långnosad fladdermus, mexikansk långnosad fladdermus, ökenpåsar, penasco ekorre, snabb råv, gulnosad bomullsråtta och grå varg. Jaguaren, som är den största inhemska amerikanska katten, ansågs vara borta från sydväst tills den sågs i New Mexico 1996.
Bland fiskar har New Mexico headwater chub, Rio Grande cutthroat trout, roundtail chub, Gila chub, Zuni bluehead sucker, Gila topminnow, Rio Grande silvery minnow, Chihuahua chub, spikedace, White Sands pupfish, gray redhorse och Sonora sucker. Loach minnow lever också i New Mexico. Loach minnows lägger allt från fem till 250 ägg under en plattsten.
Krypdjursarter inhemska New Mexico inkluderar Jemez Mountains salamander, Chiricahua leopardfrosk, borealpadda, lågland leopardfrosk och Sacramento Mountain salamander. New Mexicos inhemska reptiler inkluderar mexikansk garterorm, sandduneödla, skallningsorm, grå randig svansvippa och smalhuvad garterorm. New Mexico ridgenose rattlesnake, ansedd hotad, fortsätter att göra sitt hem i New Mexicos öknar.
Många fågelarter är inhemska New Mexico, inklusive mindre prärihöna, spragues piplärka, gulnäbbad kukuck, dvärgterne, norra aplomado falk, sydvästra willow flugsnappare, trumftran, bergsplover, mexikansk fläckig uggla, amerikansk pilgrimsfalk, arktisk pilgrimsfalk och whiskered skrikuggla. Den västra grodugglans närvaro i New Mexico har blivit alltmer svag, och den anses nu vara en art att oro sig för.
Det finns många arter i New Mexicos ryggradslösa djurgrupp, både ledsdjur och blötdjur. Ledsdjur inkluderar Noels amphipod, animas minut mossa skalbagge, Anthony blister skalbagge, bonita dykarskalbagge, öken vicekungsfjäril, kalksten tiger skalbagge, New Mexico silverspot fjäril och regal silverspot fjäril. Socorro isopoden är en akvatisk isopod skild från sina landbaserade släktingar; den överlever bara i resterna av ett termiskt bad i New Mexico. Nya mexikanska blötdjur inkluderar chupadera springsnail, Gila springsnail, Texas hornshell, Toltecus chihuanus tusenben, Dona Ana talussnail, pecos springsnail och Sangre de Cristo peaclam.