Sällskapsdjur
Förfadern som var föregångare för dagens moderna amfibier (klass Amphibia), Labyrinthodontia är den tidigaste stora amfibiegruppen direkt kopplad till reptilers evolution, vilket gör moderna reptil-amfibier – krokodiler, sköldpaddor, akvatiska ormar – levande och andande efterkommande av Labyrinthodonts. Labyrinthodonts fann uteslutande under Trias och Paleozoikum, vilket gör dem till en av de äldre reptilförfäderna.
Eftersom reptiler gradvis lämnade vattnet för längre tidsperioder tills deras liv inte längre kretsade runt det, skilde en distinkt grupp känd som cotylosauria sig från amfibier. Cotylosaurer var fysiskt liknande moderna ödlor och hade tandränder som nära påminde om sina labyrintiska akvatiska kusiner. Cotylosaurer anses vara de mest grundläggande och uråldriga förfäderna för alla landlevande reptiler såsom sköldpaddor, landormar och ödlor.
Utvecklande från landlevande cotylosaurer visar synapsida-fossil länkar till dem som förfäder till "däggdjur-liknande reptiler" såsom pelycosaurer och dimetrodoner. Anapsider förgrenade sig för att bilda olika landlevande varianter såsom pareiasaurer, millerettider och procolofonoider (moderna sköldpaddor). Alla andra moderna landlevande reptiler, såsom ormar och ödlor, kommer från gruppen diapsida.
Efter miljoner på miljoner reptila generationer har fyra moderna kategorier uppstått. Uppstått från arkosaur-gruppen Pseudosuchia, tillhör moderna krokodilier – alligatorer, krokodiler och kaimaner – reptilordningen Crocodilia. Efterkommande av Anapsida, sköldpaddor och sköldpaddor är medlemmar av ordningen Chelonia. Tuataror klassificeras till ordningen Sphenodonta och ödlor/ormar är medlemmar av den moderna ordningen Squamata, vilket gör både tuataror och ödlor/ormar till efterkommande av lepidosaurer.