Tyskland är hem för flera sällsynta djur trots sin täta befolkning:
Däggdjur
- Europäisk bison: Återintroducerad i områden som Eifel nationalpark.
- Gråvarg: Återvänder till östra Tyskland, särskilt Lausitz.
- Lodjur: Återhämtar sig i bayeriska Alperna och skogsrika områden.
- Bäver: Återkoloniserar floder som Rhinen.
- Vildkatt: Finns i bayeriska skogen och Schwabiska alperna.
Fåglar
- Havsörn: Återhämtar sig i Östersjöregionen.
- Svart stork: Finns i ouppstörda skogar och våtmarker.
- Kungsörn: Sällsynt, finns i bayeriska Alperna och Harzbergen.
- Havsörn (duplicate?): Finns längs kustområden.
- Tjäder: Finns i bayeriska Alperna och Harzbergen.
Reptiler och amfibier
- Europäisk damsköldpadda: Finns i isolerade dammar och sjöar.
- Eldsalamander: Vanlig i fukta skogar.
- Glatt snok: Finns i gräsmarker och ängar.
Fiskar
- Huchen: En stor Danubieöring.
- Europeisk ål: Kritiskt hotad, vandrande till Sargassohavet för att gyttja.
Insekter
- Sällsynt sväljfjäril: Begränsad till specifika habitat.
- Stor skogsskalbagge: Ett skyddat arter.
Övriga
- Jätte sötvattens mussla: Finns i floder och bäckar.
Tyskland har nationalparker, skyddade områden och återintroduktionsprogram för att hjälpa dessa arter att återhämta sig.