Sällskapsdjur
Forskare använder flera bevislinjer för att konstruera djurs fylogenetiska träd:
1. Jämförande morfologi: Jämföra anatomiska drag och kroppsplaner.
2. Paleontologi: Fossilregister avslöjar evolutionshistoria.
3. Molekylärbiologi och genetik: DNA-sekvensering, proteinsekvenser, molekylära klockor.
4. Utvecklingsbiologi: Jämförande embryologi visar gemensamma utvecklingsmönster.
5. Beteende- och ekologiska drag: Delade beteenden och habitat anpassningar.
6. Biogeografiska data: Geografiska utbredningsmönster.
7. Cytogenetik: Kromosomantal och strukturer.
8. Hybridisering och reproduktiv kompatibilitet: Förmåga att producera lifskraftiga avkomma.
9. Paleogenomik: Utdöd DNA-analys från utdöda arter.
Att kombinera flera bevestyper ökar noggrannheten, med metoder som maximal parsmoni, maximal sannolikhet och Bayesiansk inferens.