Sällskapsdjur
Den mest betydande faktorn som bidrar till den mexikanska vargens hotade status är livsmiljöförlust. Detta beror i stor utsträckning på omvandling av naturliga habitat till jordbruks- och stadsområden. Som ett resultat har mexikanska vargar förlorat tillgång till sitt naturliga byte och lämpliga valplacer.
Historiskt jagades och fångades mexikanska vargar för sin päls och som ett medel för rovdjurskontroll. Denna wahllösa dödande av vargar minskade deras populationer ytterligare.
Mexikanska vargar är nära besläktade med kojoter, och korsning mellan de två arterna har dokumenterats. Hybridisering kan leda till utspädning av den mexikanska vargens genetiska integritet och förlust av unika anpassningar som är avgörande för överlevnad i deras naturliga miljö.