Filippinerna är hem för en rad inhemska sötvattensfiskar, inklusive flera barb-arter. Regnbågsöring har också introducerats för kommersiella och rekreativa syften.
Inhemska arter inkluderar
- Prikig barb (Puntius binotatus): Finns i floder, bäckar och bergsjöar.
- Inhemsk barb (Puntius sp.): Känd lokalt som "dalag", finns i bergsbäckar.
- Mindoro-barb (Puntius sealei): Endemisk för Mindoro-ön.
- Palawan-barb (Puntius palata): Finns i Palawans floder och bäckar.
- Malabar röd barb (Puntius filamentosus): Introducerad och finns i sötvattensområden.
- Rödstjärtad borstbarb (Puntius erythromicron): Inhemsk i filippinska floder och bäckar.
Andra inhemska sötvattensarter inkluderar gyllene gourami, prikig knivfisk, jättegourami och vilda skalarepopulationer.
