Sällskapsdjur
De flesta fossiler består av mineraler, såsom kalcit, kiseldioxid eller pyrit. Dessa mineraler ersätter organismens ursprungliga organiska material över tid. Detta kan hända när organismen begravdes i sediment och utsätts för grundvatten som är rik på upplösta mineraler. Mineralerna infiltrerar långsamt organismens vävnader och ersätter så småningom dem. I andra fall kan organismen utsättas för varm vulkanisk aska eller lava, som snabbt kan förånga det organiska materialet och lämna en mineralgjutning. Detta kan hända antingen vid tidpunkten för ett vulkanutbrott eller som en del av andra bergbildande processer. Dessutom bevaras vissa fossiler i bärnsten (fossiliserat växtharts), medan andra kan bevaras i tjärgropar eller i torvmyror.