Gulögda pingviner står inför flera hot:
- Habitatförlust: kustutveckling och avskogning nedgraderar häcknings- och födoområden.
- Mänsklig störning: båtfärd, fiske och rekreation stressar häckande fåglar.
- Predation: införda hermeler, råttor, hundar och katter plundrar bon och dödar pingviner.
- Sjukdom: utbrott sprids snabbt i små populationer med begränsad genetisk mångfald.
- Klimatförändringar: stigande havsnivåer, stormar och skiftande strömmar påverkar föda och häckningsplatser.
- Bifångst: pingviner drunknar i fiskenät.
- Konkurrens: invasiva arter konkurrerar om föda och häckningsutrymme.
Att skydda dem kräver habitatbevarande, rovdjurskontroll, sjukdomshantering och klimatåtgärder.